instruction
stringlengths 19
61
| input
stringlengths 7
34
| output
stringlengths 132
823
| sample_id
stringlengths 1
28
| question_type
stringclasses 4
values | difficulty
stringclasses 3
values | species_involved
listlengths 0
3
|
|---|---|---|---|---|---|---|
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY04B011
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.485
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.976
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1010种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY04B011
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6889
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.467
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.839
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：247种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
6889
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYZJ03-A033
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.504
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.973
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：750种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYZJ03-A033
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2735
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.56
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.978
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：416种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2735
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6471
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.685
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.775
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：49种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
6471
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.99%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC05-A012
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.99%
- 读数：928,516
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC05-A012
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.17%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC03-A044
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.17%
- 读数：45,118
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYQC03-A044
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY06A010
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.066
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.985
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1682种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY06A010
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 4435 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 4435
|
根据样本 4435 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：38,695,503
- 检出物种数：375
- Shannon多样性指数：2.905
- Simpson多样性指数：0.848
**二、优势菌群**
- Janthinobacterium tructae (34.8%)
- Pseudomonas fluorescens (8.7%)
- Janthinobacterium svalbardensis (7.9%)
- Pseudomonas sivasensis (7.7%)
- Janthinobacterium agaricidamnosum (7.6%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
4435
|
overview
|
basic
|
[
"Janthinobacterium tructae (34.8%)",
"Pseudomonas fluorescens (8.7%)",
"Janthinobacterium svalbardensis (7.9%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: NTC20250207-3
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.246
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.933
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：201种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
NTC20250207-3
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 6435 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 6435
|
根据样本 6435 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：8,730,860
- 检出物种数：74
- Shannon多样性指数：2.88
- Simpson多样性指数：0.917
**二、优势菌群**
- Gilliamella apicola (19.0%)
- Apis mellifera (12.9%)
- Bombilactobacillus mellis (9.2%)
- Lactobacillus helsingborgensis (7.1%)
- Lactobacillus melliventris (6.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
6435
|
overview
|
basic
|
[
"Gilliamella apicola (19.0%)",
"Apis mellifera (12.9%)",
"Bombilactobacillus mellis (9.2%)"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.84%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC04-H005
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.84%
- 读数：815,960
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC04-H005
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4307
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.151
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.789
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：416种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4307
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 3272 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 3272
|
根据样本 3272 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：28,031,091
- 检出物种数：306
- Shannon多样性指数：3.349
- Simpson多样性指数：0.937
**二、优势菌群**
- Bacteroides xylanisolvens (13.4%)
- Bacteroides uniformis (10.9%)
- Bacteroides thetaiotaomicron (8.9%)
- Bacteroides koreensis (8.1%)
- Bacteroides ovatus (7.7%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
3272
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides xylanisolvens (13.4%)",
"Bacteroides uniformis (10.9%)",
"Bacteroides thetaiotaomicron (8.9%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1630
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola dorei (13.5%)
- Enterocloster bolteae (10.7%)
- Bacteroides caccae (5.6%)
- Blautia glucerasea (5.0%)
- Ruthenibacterium lactatiformans (4.9%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.965，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：295个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
1630
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola dorei (13.5%)",
"Enterocloster bolteae (10.7%)",
"Bacteroides caccae (5.6%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY07E039
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Porphyromonas gingivalis（牙龈卟啉单胞菌）- 风险等级：medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY07E039
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Fusobacterium nucleatum",
"Porphyromonas gingivalis"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: ZYYH05-A002
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Lachnoanaerobaculum saburreum (5.7%)
- Streptococcus mitis (4.4%)
- Veillonella parvula (4.4%)
- Veillonella hominis (3.4%)
- Prevotella melaninogenica (3.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.897，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1069个物种
**关键发现：**
- 检出 16 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
ZYYH05-A002
|
overview
|
basic
|
[
"Lachnoanaerobaculum saburreum (5.7%)",
"Streptococcus mitis (4.4%)",
"Veillonella parvula (4.4%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6827
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Parvularcula marina (20.7%)
- Neospora caninum (18.5%)
- Nesterenkonia natronophila (18.5%)
- Sus scrofa (11.7%)
- Alteribacter natronophilus (6.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.355，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：65个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
6827
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (20.7%)",
"Neospora caninum (18.5%)",
"Nesterenkonia natronophila (18.5%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6997
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.397
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.921
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：520种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
6997
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 ZYYH02-H005 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: ZYYH02-H005
|
根据样本 ZYYH02-H005 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：61,521,080
- 检出物种数：1615
- Shannon多样性指数：4.864
- Simpson多样性指数：0.981
**二、优势菌群**
- Rothia mucilaginosa (6.9%)
- Lysobacter prati (5.1%)
- Nocardioides agariphilus (5.0%)
- Schaalia odontolytica (3.2%)
- Streptococcus mitis (2.6%)
**三、检出病原体情况**
检出 13 种潜在病原体：
- Streptococcus pneumoniae
- Fusobacterium nucleatum
- Campylobacter concisus
- Neisseria meningitidis
- Prevotella intermedia
- Haemophilus influenzae
- Tannerella forsythia
- Aggregatibacter actinomycetemcomitans
- Enterococcus faecium
- Porphyromonas gingivalis
- Cutibacterium acnes
- Treponema denticola
- Legionella pneumophila
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
ZYYH02-H005
|
overview
|
basic
|
[
"Rothia mucilaginosa (6.9%)",
"Lysobacter prati (5.1%)",
"Nocardioides agariphilus (5.0%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 7119
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Neospora caninum (22.0%)
- Parvularcula marina (20.7%)
- Nesterenkonia natronophila (15.2%)
- Sus scrofa (15.1%)
- Alteribacter natronophilus (6.8%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.412，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：178个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
7119
|
overview
|
basic
|
[
"Neospora caninum (22.0%)",
"Parvularcula marina (20.7%)",
"Nesterenkonia natronophila (15.2%)"
] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 0.32%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY01A028
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.32%
- 读数：261,294
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY01A028
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2142
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.36
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.923
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：458种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2142
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 5294
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Limnohabitans parvus (7.5%)
- Polynucleobacter victoriensis (5.9%)
- Limnohabitans planktonicus (4.5%)
- Polynucleobacter cosmopolitanus (3.8%)
- Limnohabitans radicicola (3.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.213，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：604个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
5294
|
overview
|
basic
|
[
"Limnohabitans parvus (7.5%)",
"Polynucleobacter victoriensis (5.9%)",
"Limnohabitans planktonicus (4.5%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 81
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.186
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.826
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：118种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
81
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1484
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Pan troglodytes (36.6%)
- Actinomadura cremea (9.6%)
- Naegleria fowleri (9.5%)
- Chlorocebus aethiops (9.4%)
- Pongo abelii (8.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.298，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：74个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
1484
|
overview
|
basic
|
[
"Pan troglodytes (36.6%)",
"Actinomadura cremea (9.6%)",
"Naegleria fowleri (9.5%)"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.18%，请评估其临床意义。
|
样本ID: LJDX-01-A034
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.18%
- 读数：71,337
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
LJDX-01-A034
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: NTC20250225-1
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.17
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.922
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：190种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
NTC20250225-1
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3669
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.14
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.961
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：404种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3669
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: JXEY04A001
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella jejuni (6.2%)
- Leptotrichia wadei (4.8%)
- Prevotella melaninogenica (3.9%)
- Nocardioides agariphilus (3.6%)
- Veillonella atypica (3.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.744，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1099个物种
**关键发现：**
- 检出 11 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
JXEY04A001
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella jejuni (6.2%)",
"Leptotrichia wadei (4.8%)",
"Prevotella melaninogenica (3.9%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY05B005
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Enterococcus faecium（屎肠球菌）- 风险等级：high
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY05B005
|
clinical
|
advanced
|
[
"Enterococcus faecium",
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3858
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.274
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.935
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：320种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3858
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4466
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.326
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.896
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：229种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4466
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.07%，请评估其临床意义。
|
样本ID: LJDX-01-A037
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.07%
- 读数：21,114
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
LJDX-01-A037
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 177
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.572
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.869
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：465种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
177
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 1496 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 1496
|
根据样本 1496 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：2,459,744
- 检出物种数：79
- Shannon多样性指数：1.999
- Simpson多样性指数：0.792
**二、优势菌群**
- Corynebacterium accolens (31.1%)
- Corynebacterium segmentosum (28.5%)
- Pan troglodytes (15.4%)
- Chlorocebus aethiops (3.8%)
- Naegleria fowleri (3.7%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
1496
|
overview
|
basic
|
[
"Corynebacterium accolens (31.1%)",
"Corynebacterium segmentosum (28.5%)",
"Pan troglodytes (15.4%)"
] |
检测到 Staphylococcus aureus，丰度为 0.34%，请评估其临床意义。
|
样本ID: PTC20241227-1
|
Staphylococcus aureus（金黄色葡萄球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.34%
- 读数：8,712
- 致病类别：skin
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
PTC20241227-1
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Staphylococcus aureus"
] |
请分析样本 5017 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5017
|
根据样本 5017 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：6,972,021
- 检出物种数：1448
- Shannon多样性指数：5.372
- Simpson多样性指数：0.98
**二、优势菌群**
- Defluviitoga tunisiensis (9.1%)
- Trichococcus flocculiformis (6.9%)
- Faecalibacterium prausnitzii (4.4%)
- Lactococcus raffinolactis (2.3%)
- Enterococcus aquimarinus (2.2%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5017
|
overview
|
basic
|
[
"Defluviitoga tunisiensis (9.1%)",
"Trichococcus flocculiformis (6.9%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (4.4%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1443
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.103
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.957
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：495种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1443
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3210
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.93
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.885
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：284种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3210
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.36%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC03-A005
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.36%
- 读数：337,050
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYQC03-A005
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.44%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY07D023
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.44%
- 读数：350,122
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
JXEY07D023
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 0.52%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYZJ02-A032
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.52%
- 读数：261,091
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYZJ02-A032
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1572
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.518
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.6
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：147种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
1572
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2180
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.985
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.959
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：401种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2180
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 3876 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 3876
|
根据样本 3876 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：21,344,131
- 检出物种数：187
- Shannon多样性指数：1.67
- Simpson多样性指数：0.517
**二、优势菌群**
- Bacteroides fragilis (69.1%)
- Phocaeicola coprocola (3.8%)
- Bifidobacterium longum (3.4%)
- Bacteroides eggerthii (2.2%)
- Phocaeicola massiliensis (1.8%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
3876
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides fragilis (69.1%)",
"Phocaeicola coprocola (3.8%)",
"Bifidobacterium longum (3.4%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2797
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Brotolimicola acetigignens (6.8%)
- Coprococcus eutactus (5.2%)
- Faecalibacterium prausnitzii (5.0%)
- Bacteroides uniformis (4.0%)
- Simiaoa sunii (3.8%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.457，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：431个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
2797
|
overview
|
basic
|
[
"Brotolimicola acetigignens (6.8%)",
"Coprococcus eutactus (5.2%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (5.0%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1501
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.459
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.895
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：328种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1501
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 6836 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 6836
|
根据样本 6836 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,460,124
- 检出物种数：72
- Shannon多样性指数：1.822
- Simpson多样性指数：0.794
**二、优势菌群**
- Parvularcula marina (29.3%)
- Nesterenkonia natronophila (23.7%)
- Neospora caninum (19.0%)
- Sus scrofa (15.6%)
- Alteribacter natronophilus (5.4%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
6836
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (29.3%)",
"Nesterenkonia natronophila (23.7%)",
"Neospora caninum (19.0%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY07D025
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY07D025
|
clinical
|
advanced
|
[
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus",
"Streptococcus pneumoniae"
] |
请分析样本 298 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 298
|
根据样本 298 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：6,224,755
- 检出物种数：657
- Shannon多样性指数：3.131
- Simpson多样性指数：0.922
**二、优势菌群**
- Shigella dysenteriae (12.8%)
- Shigella flexneri (12.5%)
- Escherichia coli (12.5%)
- Shigella sonnei (11.2%)
- Shigella boydii (9.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
298
|
overview
|
basic
|
[
"Shigella dysenteriae (12.8%)",
"Shigella flexneri (12.5%)",
"Escherichia coli (12.5%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: ZYQC03-A044
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Veillonella atypica (3.7%)
- Veillonella dispar (3.1%)
- Schaalia odontolytica (2.8%)
- Veillonella rogosae (2.7%)
- Veillonella nakazawae (2.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.989，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1025个物种
**关键发现：**
- 检出 12 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Veillonella属），总体正常
|
ZYQC03-A044
|
overview
|
basic
|
[
"Veillonella atypica (3.7%)",
"Veillonella dispar (3.1%)",
"Schaalia odontolytica (2.8%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 987
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.722
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.952
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：448种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
987
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1896
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.63
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.937
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：494种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1896
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 3325 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 3325
|
根据样本 3325 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：19,670,630
- 检出物种数：524
- Shannon多样性指数：3.656
- Simpson多样性指数：0.894
**二、优势菌群**
- Akkermansia muciniphila (29.6%)
- Enterococcus avium (7.4%)
- Faecalibacterium prausnitzii (6.3%)
- Faecalibacterium longum (5.4%)
- Pseudoruminococcus massiliensis (3.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
3325
|
overview
|
basic
|
[
"Akkermansia muciniphila (29.6%)",
"Enterococcus avium (7.4%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (6.3%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 3466
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola dorei (41.7%)
- Bacteroides uniformis (9.4%)
- Phocaeicola vulgatus (6.7%)
- Bacteroides clarus (5.4%)
- Faecalibacterium prausnitzii (3.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.739，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：342个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
3466
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola dorei (41.7%)",
"Bacteroides uniformis (9.4%)",
"Phocaeicola vulgatus (6.7%)"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.71%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY07D004
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.71%
- 读数：392,306
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
JXEY07D004
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4679
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.749
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.991
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：848种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4679
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYYH03-H005
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYYH03-H005
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.72%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC01-A005
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.72%
- 读数：496,281
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC01-A005
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY04C043
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）- 风险等级：critical
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY04C043
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Neisseria meningitidis"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 3996
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Shigella flexneri (4.9%)
- Phocaeicola dorei (4.7%)
- Brotolimicola acetigignens (3.6%)
- Phocaeicola vulgatus (3.5%)
- Roseburia intestinalis (3.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.638，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：612个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌含潜在致病属（Shigella），需警惕
|
3996
|
overview
|
basic
|
[
"Shigella flexneri (4.9%)",
"Phocaeicola dorei (4.7%)",
"Brotolimicola acetigignens (3.6%)"
] |
请分析样本 983 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 983
|
根据样本 983 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：29,654,585
- 检出物种数：396
- Shannon多样性指数：4.073
- Simpson多样性指数：0.964
**二、优势菌群**
- Blautia wexlerae (12.4%)
- Phocaeicola coprocola (6.3%)
- Megamonas funiformis (4.6%)
- Roseburia intestinalis (4.4%)
- Faecalibacterium prausnitzii (4.2%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
983
|
overview
|
basic
|
[
"Blautia wexlerae (12.4%)",
"Phocaeicola coprocola (6.3%)",
"Megamonas funiformis (4.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY06A028
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.657
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.854
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1553种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY06A028
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2867
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.532
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.716
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：452种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2867
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1910
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.773
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.938
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：430种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1910
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 3286
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.605
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.949
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：354种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
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3286
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interpretation
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intermediate
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[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
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样本ID: 7680
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样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bacteroides thetaiotaomicron (72.6%)
- Klebsiella oxytoca (12.3%)
- Bacteroides faecis (7.3%)
- Parasutterella excrementihominis (2.3%)
- Mus musculus (1.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.056，表明菌群多样性较低
- 物种丰富度：35个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
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7680
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overview
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basic
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[
"Bacteroides thetaiotaomicron (72.6%)",
"Klebsiella oxytoca (12.3%)",
"Bacteroides faecis (7.3%)"
] |
请分析样本 JXEY02C024 的微生物检测结果概况。
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样本ID: JXEY02C024
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根据样本 JXEY02C024 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：35,938,055
- 检出物种数：1343
- Shannon多样性指数：4.81
- Simpson多样性指数：0.978
**二、优势菌群**
- Streptococcus mitis (8.6%)
- Streptococcus oralis (6.6%)
- Gemella haemolysans (5.6%)
- Gemella sanguinis (2.9%)
- Nocardioides agariphilus (2.6%)
**三、检出病原体情况**
检出 15 种潜在病原体：
- Streptococcus pneumoniae
- Fusobacterium nucleatum
- Prevotella intermedia
- Campylobacter concisus
- Tannerella forsythia
- Treponema denticola
- Porphyromonas gingivalis
- Neisseria meningitidis
- Moraxella catarrhalis
- Enterococcus faecium
- Haemophilus influenzae
- Candida albicans
- Aggregatibacter actinomycetemcomitans
- Cutibacterium acnes
- Klebsiella pneumoniae
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
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JXEY02C024
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overview
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basic
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[
"Streptococcus mitis (8.6%)",
"Streptococcus oralis (6.6%)",
"Gemella haemolysans (5.6%)"
] |
请分析样本 7487 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 7487
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根据样本 7487 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,284,247
- 检出物种数：36
- Shannon多样性指数：2.188
- Simpson多样性指数：0.832
**二、优势菌群**
- Anas platyrhynchos (34.0%)
- Mesorhizobium silamurunense (14.7%)
- Cobetia crustatorum (10.5%)
- Anser cygnoides (7.7%)
- Elizabethkingia argenteiflava (6.2%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
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7487
|
overview
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basic
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[
"Anas platyrhynchos (34.0%)",
"Mesorhizobium silamurunense (14.7%)",
"Cobetia crustatorum (10.5%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
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样本ID: ZYQC02-H003
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治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
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ZYQC02-H003
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clinical
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advanced
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[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 3220
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.532
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.898
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：437种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
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3220
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interpretation
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intermediate
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[] |
请分析样本 3830 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 3830
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根据样本 3830 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：24,333,531
- 检出物种数：330
- Shannon多样性指数：3.381
- Simpson多样性指数：0.918
**二、优势菌群**
- Prevotella copri (22.8%)
- Phocaeicola vulgatus (8.8%)
- Bacteroides caccae (8.1%)
- Phocaeicola dorei (7.2%)
- Bacteroides thetaiotaomicron (4.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
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3830
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overview
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basic
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[
"Prevotella copri (22.8%)",
"Phocaeicola vulgatus (8.8%)",
"Bacteroides caccae (8.1%)"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.47%，请评估其临床意义。
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样本ID: ZYZJ06-A048
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Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.47%
- 读数：268,872
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
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ZYZJ06-A048
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pathogen
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intermediate
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[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 1518
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.655
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.937
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：539种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
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1518
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interpretation
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intermediate
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[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 3711
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.104
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.881
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：285种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
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3711
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interpretation
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intermediate
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[] |
检测到 Klebsiella pneumoniae，丰度为 0.00%，请评估其临床意义。
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样本ID: JXEY04A012
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Klebsiella pneumoniae（肺炎克雷伯菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.00%
- 读数：146
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
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JXEY04A012
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pathogen
|
intermediate
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[
"Klebsiella pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 5076
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.703
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.989
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：2086种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
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5076
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interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
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样本ID: 427
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样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Roseburia intestinalis (20.7%)
- [Clostridium] innocuum (8.8%)
- [Clostridium] nexile (7.9%)
- Coprococcus phoceensis (7.7%)
- Hungatella hathewayi (6.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.4，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：195个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
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427
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overview
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basic
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[
"Roseburia intestinalis (20.7%)",
"[Clostridium] innocuum (8.8%)",
"[Clostridium] nexile (7.9%)"
] |
请分析样本 4217 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 4217
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根据样本 4217 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：5,530,065
- 检出物种数：395
- Shannon多样性指数：2.014
- Simpson多样性指数：0.666
**二、优势菌群**
- Cutibacterium acnes (54.5%)
- Malassezia restricta (17.7%)
- Cutibacterium modestum (5.7%)
- Malassezia globosa (2.8%)
- Staphylococcus capitis (2.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
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4217
|
overview
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basic
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[
"Cutibacterium acnes (54.5%)",
"Malassezia restricta (17.7%)",
"Cutibacterium modestum (5.7%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 3337
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.633
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.93
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：432种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
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3337
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
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样本ID: 221
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样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Shigella dysenteriae (16.4%)
- Escherichia coli (16.2%)
- Shigella flexneri (15.3%)
- Shigella sonnei (13.2%)
- Shigella boydii (11.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.706，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：176个物种
**关键发现：**
- 优势菌含潜在致病属（Shigella），需警惕
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221
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overview
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basic
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[
"Shigella dysenteriae (16.4%)",
"Escherichia coli (16.2%)",
"Shigella flexneri (15.3%)"
] |
请分析样本 1555 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 1555
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根据样本 1555 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：866,979
- 检出物种数：63
- Shannon多样性指数：2.199
- Simpson多样性指数：0.811
**二、优势菌群**
- Pan troglodytes (38.6%)
- Chlorocebus aethiops (9.8%)
- Naegleria fowleri (9.7%)
- Pongo abelii (8.8%)
- Actinomadura cremea (7.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
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1555
|
overview
|
basic
|
[
"Pan troglodytes (38.6%)",
"Chlorocebus aethiops (9.8%)",
"Naegleria fowleri (9.7%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 942
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.786
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.939
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：471种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
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942
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interpretation
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intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 420
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.279
多样性显著降低，提示可能存在明显菌群失调或优势菌过度增殖
- Simpson指数：0.568
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：170种
**菌群平衡状态评估：**
明显菌群失调，需进一步评估原因并考虑干预。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
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420
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interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 5670
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.403
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.992
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：395种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
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5670
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 6763
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.949
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.798
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：144种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
6763
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 694 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 694
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根据样本 694 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：29,841,769
- 检出物种数：430
- Shannon多样性指数：4.257
- Simpson多样性指数：0.959
**二、优势菌群**
- Faecalibacterium prausnitzii (15.7%)
- Faecalibacterium longum (6.7%)
- Phocaeicola vulgatus (6.0%)
- Phocaeicola plebeius (3.3%)
- Roseburia faecis (3.3%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
694
|
overview
|
basic
|
[
"Faecalibacterium prausnitzii (15.7%)",
"Faecalibacterium longum (6.7%)",
"Phocaeicola vulgatus (6.0%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
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样本ID: 303
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样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Klebsiella oxytoca (36.5%)
- Klebsiella michiganensis (30.2%)
- Leclercia adecarboxylata (14.1%)
- Enterobacter cloacae (2.5%)
- Klebsiella grimontii (1.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.0，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：105个物种
**关键发现：**
- 优势菌含潜在致病属（Klebsiella），需警惕
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303
|
overview
|
basic
|
[
"Klebsiella oxytoca (36.5%)",
"Klebsiella michiganensis (30.2%)",
"Leclercia adecarboxylata (14.1%)"
] |
检测到 Staphylococcus aureus，丰度为 0.76%，请评估其临床意义。
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样本ID: PTC20250106-1
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Staphylococcus aureus（金黄色葡萄球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.76%
- 读数：18,599
- 致病类别：skin
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
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PTC20250106-1
|
pathogen
|
intermediate
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[
"Staphylococcus aureus"
] |
请分析样本 4077 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 4077
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根据样本 4077 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：6,852,618
- 检出物种数：1787
- Shannon多样性指数：4.098
- Simpson多样性指数：0.932
**二、优势菌群**
- Enterococcus faecalis (22.4%)
- Enterococcus faecium (8.0%)
- Blautia caecimuris (7.2%)
- [Clostridium] scindens (3.4%)
- Enterococcus lactis (2.6%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
4077
|
overview
|
basic
|
[
"Enterococcus faecalis (22.4%)",
"Enterococcus faecium (8.0%)",
"Blautia caecimuris (7.2%)"
] |
请分析样本 5262 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 5262
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根据样本 5262 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：676,248
- 检出物种数：405
- Shannon多样性指数：5.251
- Simpson多样性指数：0.989
**二、优势菌群**
- Sulfuritalea hydrogenivorans (5.2%)
- Ferribacterium limneticum (4.2%)
- Nitrosomonas oligotropha (3.6%)
- Dechloromonas denitrificans (2.1%)
- Aquabacterium pictum (2.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5262
|
overview
|
basic
|
[
"Sulfuritalea hydrogenivorans (5.2%)",
"Ferribacterium limneticum (4.2%)",
"Nitrosomonas oligotropha (3.6%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
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样本ID: 6557
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样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Parvularcula marina (28.3%)
- Nesterenkonia natronophila (21.6%)
- Neospora caninum (20.6%)
- Sus scrofa (11.8%)
- Alteribacter natronophilus (5.1%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.159，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：152个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
6557
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (28.3%)",
"Nesterenkonia natronophila (21.6%)",
"Neospora caninum (20.6%)"
] |
请分析样本 7468 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 7468
|
根据样本 7468 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：24,538,194
- 检出物种数：628
- Shannon多样性指数：4.25
- Simpson多样性指数：0.965
**二、优势菌群**
- Bacteroides caecigallinarum (10.8%)
- Phocaeicola barnesiae (8.8%)
- Mediterraneibacter catenae (5.1%)
- Phocaeicola coprocola (4.2%)
- Bacteroides ndongoniae (4.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
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7468
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides caecigallinarum (10.8%)",
"Phocaeicola barnesiae (8.8%)",
"Mediterraneibacter catenae (5.1%)"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.13%，请评估其临床意义。
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样本ID: ZYQC02-A040
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Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.13%
- 读数：65,487
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
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ZYQC02-A040
|
pathogen
|
intermediate
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[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
请分析样本 5777 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 5777
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根据样本 5777 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：40,847,176
- 检出物种数：29
- Shannon多样性指数：0.858
- Simpson多样性指数：0.532
**二、优势菌群**
- Bathymodiolus azoricus thioautotrophic gill symbiont (49.3%)
- thiotrophic endosymbiont of Bathymodiolus puteoserpentis (Logatchev) (47.4%)
- Bathymodiolus brooksi thiotrophic gill symbiont (1.6%)
- methanotrophic endosymbiont of Bathymodiolus puteoserpentis (Logatchev) (1.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性显著降低，可能存在菌群失调，需关注潜在感染风险。
|
5777
|
overview
|
basic
|
[
"Bathymodiolus azoricus thioautotrophic gill symbiont (49.3%)",
"thiotrophic endosymbiont of Bathymodiolus puteoserpentis (Logatchev) (47.4%)",
"Bathymodiolus brooksi thiotrophic gill symbiont (1.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 6768
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.939
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.818
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：54种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
6768
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5796
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.729
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.991
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：906种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5796
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interpretation
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intermediate
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[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 4448
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.245
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.933
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：958种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
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4448
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interpretation
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intermediate
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[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
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样本ID: 1523
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样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Gemmiger formicilis (11.1%)
- Faecalibacterium prausnitzii (7.7%)
- Faecalibacterium duncaniae (5.2%)
- [Ruminococcus] torques (4.8%)
- Mediterraneibacter faecis (4.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.142，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：449个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
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1523
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overview
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basic
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[
"Gemmiger formicilis (11.1%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (7.7%)",
"Faecalibacterium duncaniae (5.2%)"
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