instruction
stringlengths 19
61
| input
stringlengths 7
34
| output
stringlengths 132
823
| sample_id
stringlengths 1
28
| question_type
stringclasses 4
values | difficulty
stringclasses 3
values | species_involved
listlengths 0
3
|
|---|---|---|---|---|---|---|
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY05A012
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY05A012
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus"
] |
请分析样本 875 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 875
|
根据样本 875 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：4,563,503
- 检出物种数：350
- Shannon多样性指数：4.399
- Simpson多样性指数：0.967
**二、优势菌群**
- Faecalibacterium prausnitzii (12.0%)
- Gemmiger qucibialis (6.8%)
- Alistipes putredinis (6.4%)
- Alistipes shahii (4.6%)
- Alistipes dispar (4.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
875
|
overview
|
basic
|
[
"Faecalibacterium prausnitzii (12.0%)",
"Gemmiger qucibialis (6.8%)",
"Alistipes putredinis (6.4%)"
] |
请分析样本 NTC20250221-2 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: NTC20250221-2
|
根据样本 NTC20250221-2 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：4,011,662
- 检出物种数：164
- Shannon多样性指数：3.022
- Simpson多样性指数：0.913
**二、优势菌群**
- Arabidopsis thaliana (18.0%)
- Ehrlichia minasensis (17.4%)
- Nocardioides agariphilus (9.4%)
- Vibrio marinisediminis (7.4%)
- Deinococcus aestuarii (4.2%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
NTC20250221-2
|
overview
|
basic
|
[
"Arabidopsis thaliana (18.0%)",
"Ehrlichia minasensis (17.4%)",
"Nocardioides agariphilus (9.4%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3243
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.316
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.906
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：347种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3243
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYQC05-A062
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC05-A062
|
clinical
|
advanced
|
[
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus",
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1067
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bifidobacterium longum (8.7%)
- Wujia chipingensis (8.6%)
- Faecalibacterium prausnitzii (5.0%)
- Ruminococcus bromii (2.7%)
- Faecalibacterium duncaniae (2.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.545，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：424个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
1067
|
overview
|
basic
|
[
"Bifidobacterium longum (8.7%)",
"Wujia chipingensis (8.6%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (5.0%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: eZYZJ03-A001
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Cutibacterium acnes（痤疮丙酸杆菌）- 风险等级：low
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Cryptococcus neoformans（新型隐球菌）- 风险等级：high
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 暂无需抗菌治疗
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
eZYZJ03-A001
|
clinical
|
advanced
|
[
"Cutibacterium acnes",
"Fusobacterium nucleatum",
"Cryptococcus neoformans"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4492
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.312
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.984
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：866种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4492
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.71%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC03-H004
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.71%
- 读数：409,687
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC03-H004
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 0.15%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYZJ03-A028
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.15%
- 读数：125,915
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYZJ03-A028
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2486
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.748
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.982
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：473种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2486
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 5216 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5216
|
根据样本 5216 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：673,922
- 检出物种数：430
- Shannon多样性指数：5.387
- Simpson多样性指数：0.991
**二、优势菌群**
- Sulfuritalea hydrogenivorans (4.0%)
- Nitrosomonas oligotropha (4.0%)
- Ferribacterium limneticum (2.5%)
- Ornithinibacter aureus (1.8%)
- Phycicoccus elongatus (1.6%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5216
|
overview
|
basic
|
[
"Sulfuritalea hydrogenivorans (4.0%)",
"Nitrosomonas oligotropha (4.0%)",
"Ferribacterium limneticum (2.5%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2422
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola vulgatus (13.5%)
- Bacteroides uniformis (6.1%)
- Faecalibacterium prausnitzii (4.1%)
- Fusicatenibacter saccharivorans (3.1%)
- Phocaeicola massiliensis (3.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.391，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：398个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
2422
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (13.5%)",
"Bacteroides uniformis (6.1%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (4.1%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2949
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bacteroides thetaiotaomicron (33.6%)
- Bacteroides uniformis (9.1%)
- Shigella flexneri (7.2%)
- Shigella dysenteriae (7.0%)
- Escherichia coli (7.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.735，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：293个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
2949
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides thetaiotaomicron (33.6%)",
"Bacteroides uniformis (9.1%)",
"Shigella flexneri (7.2%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3363
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.766
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.767
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：323种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3363
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5192
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.62
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.963
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：367种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5192
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 JXEY01D004 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: JXEY01D004
|
根据样本 JXEY01D004 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：17,458,799
- 检出物种数：807
- Shannon多样性指数：4.478
- Simpson多样性指数：0.977
**二、优势菌群**
- Nocardioides agariphilus (7.4%)
- Ramlibacter humi (4.8%)
- Pan troglodytes (4.2%)
- Ehrlichia minasensis (4.2%)
- Actinomadura cremea (3.9%)
**三、检出病原体情况**
检出 12 种潜在病原体：
- Streptococcus pneumoniae
- Fusobacterium nucleatum
- Neisseria meningitidis
- Haemophilus influenzae
- Prevotella intermedia
- Campylobacter concisus
- Treponema denticola
- Tannerella forsythia
- Staphylococcus aureus
- Aggregatibacter actinomycetemcomitans
- Cryptococcus neoformans
- Cutibacterium acnes
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
JXEY01D004
|
overview
|
basic
|
[
"Nocardioides agariphilus (7.4%)",
"Ramlibacter humi (4.8%)",
"Pan troglodytes (4.2%)"
] |
请分析样本 274 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 274
|
根据样本 274 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,873,173
- 检出物种数：255
- Shannon多样性指数：3.433
- Simpson多样性指数：0.871
**二、优势菌群**
- Prevotella copri (33.9%)
- Catenibacterium faecis (7.5%)
- Catenibacterium mitsuokai (4.0%)
- Blautia wexlerae (3.6%)
- Phocaeicola vulgatus (3.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
274
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (33.9%)",
"Catenibacterium faecis (7.5%)",
"Catenibacterium mitsuokai (4.0%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: ZYZJ02-A023
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Gemella haemolysans (3.7%)
- Nocardioides agariphilus (3.4%)
- Lysobacter prati (3.1%)
- Streptomyces gancidicus (2.8%)
- Neisseria subflava (2.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.962，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1011个物种
**关键发现：**
- 检出 11 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
ZYZJ02-A023
|
overview
|
basic
|
[
"Gemella haemolysans (3.7%)",
"Nocardioides agariphilus (3.4%)",
"Lysobacter prati (3.1%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4324
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bifidobacterium longum (23.8%)
- Bacteroides stercoris (10.4%)
- Bacteroides eggerthii (6.6%)
- Phocaeicola vulgatus (3.8%)
- Flavonifractor plautii (3.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.615，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：323个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
4324
|
overview
|
basic
|
[
"Bifidobacterium longum (23.8%)",
"Bacteroides stercoris (10.4%)",
"Bacteroides eggerthii (6.6%)"
] |
请分析样本 513 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 513
|
根据样本 513 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：320,799,817
- 检出物种数：612
- Shannon多样性指数：4.327
- Simpson多样性指数：0.964
**二、优势菌群**
- Phocaeicola vulgatus (13.8%)
- Bacteroides uniformis (6.9%)
- Phocaeicola plebeius (5.7%)
- Alistipes putredinis (4.0%)
- Faecalibacterium prausnitzii (3.7%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
513
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (13.8%)",
"Bacteroides uniformis (6.9%)",
"Phocaeicola plebeius (5.7%)"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.42%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC03-A010
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.42%
- 读数：240,547
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC03-A010
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYQC05-A047
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.941
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.868
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1079种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYQC05-A047
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: ZYQC07-A022
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Schaalia odontolytica (4.7%)
- Nocardioides agariphilus (3.5%)
- Rothia mucilaginosa (3.2%)
- Lysobacter prati (2.9%)
- Actinomyces bouchesdurhonensis (2.9%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.967，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1514个物种
**关键发现：**
- 检出 13 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
ZYQC07-A022
|
overview
|
basic
|
[
"Schaalia odontolytica (4.7%)",
"Nocardioides agariphilus (3.5%)",
"Rothia mucilaginosa (3.2%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYQC03-A028
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC03-A028
|
clinical
|
advanced
|
[
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus",
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1658
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola dorei (19.3%)
- Bacteroides uniformis (12.5%)
- Parabacteroides distasonis (7.5%)
- Alistipes onderdonkii (7.1%)
- Phocaeicola vulgatus (6.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.316，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：186个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
1658
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola dorei (19.3%)",
"Bacteroides uniformis (12.5%)",
"Parabacteroides distasonis (7.5%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2140
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.467
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.941
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：443种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2140
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1149
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.406
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.851
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：73种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1149
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3075
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.979
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.887
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：410种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3075
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 3928 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 3928
|
根据样本 3928 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：24,875,085
- 检出物种数：231
- Shannon多样性指数：2.691
- Simpson多样性指数：0.897
**二、优势菌群**
- Shigella flexneri (15.0%)
- Escherichia coli (14.8%)
- Shigella dysenteriae (14.8%)
- Shigella sonnei (12.6%)
- Shigella boydii (11.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
3928
|
overview
|
basic
|
[
"Shigella flexneri (15.0%)",
"Escherichia coli (14.8%)",
"Shigella dysenteriae (14.8%)"
] |
请分析样本 5157 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5157
|
根据样本 5157 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：9,788,616
- 检出物种数：1649
- Shannon多样性指数：5.471
- Simpson多样性指数：0.986
**二、优势菌群**
- Comamonas denitrificans (5.8%)
- Uruburuella suis (4.4%)
- Brachymonas denitrificans (3.6%)
- Acidovorax carolinensis (3.4%)
- Psychrobacter pulmonis (2.9%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5157
|
overview
|
basic
|
[
"Comamonas denitrificans (5.8%)",
"Uruburuella suis (4.4%)",
"Brachymonas denitrificans (3.6%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY01D016
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）- 风险等级：critical
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY01D016
|
clinical
|
advanced
|
[
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus",
"Neisseria meningitidis"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3319
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.454
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.945
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：329种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3319
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4724
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：6.248
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.994
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1448种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4724
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Neisseria meningitidis，丰度为 0.16%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYYH06-A019
|
Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.16%
- 读数：50,302
- 致病类别：systemic
- 临床风险等级：critical
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 立即进行确认检测
2. 启动感染控制措施
3. 进行药敏试验
4. 考虑会诊感染科
|
ZYYH06-A019
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Neisseria meningitidis"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7013
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.91
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.798
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：107种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
7013
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY01C020
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.472
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.959
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1145种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY01C020
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYZJ03-A033
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Porphyromonas gingivalis（牙龈卟啉单胞菌）- 风险等级：medium
- Treponema denticola（齿垢密螺旋体）- 风险等级：medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYZJ03-A033
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Porphyromonas gingivalis",
"Treponema denticola"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 7172
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Neospora caninum (34.3%)
- Parvularcula marina (24.6%)
- Nesterenkonia natronophila (18.4%)
- Sus scrofa (10.8%)
- Alteribacter natronophilus (8.1%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.718，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：89个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
|
7172
|
overview
|
basic
|
[
"Neospora caninum (34.3%)",
"Parvularcula marina (24.6%)",
"Nesterenkonia natronophila (18.4%)"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.26%，请评估其临床意义。
|
样本ID: LJDX-03-A006
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.26%
- 读数：52,420
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
LJDX-03-A006
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.33%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYYH02-H001
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.33%
- 读数：158,569
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYYH02-H001
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
请分析样本 2790 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 2790
|
根据样本 2790 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：15,808,165
- 检出物种数：434
- Shannon多样性指数：4.573
- Simpson多样性指数：0.979
**二、优势菌群**
- Alistipes onderdonkii (7.5%)
- Phocaeicola dorei (5.5%)
- Bacteroides uniformis (3.6%)
- Alistipes putredinis (3.3%)
- Gemmiger formicilis (3.3%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
2790
|
overview
|
basic
|
[
"Alistipes onderdonkii (7.5%)",
"Phocaeicola dorei (5.5%)",
"Bacteroides uniformis (3.6%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6211
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Mus musculus (39.4%)
- Natronorubrum sulfidifaciens (11.2%)
- Lepagella muris (7.5%)
- Akkermansia muciniphila (3.7%)
- Duncaniella muris (3.1%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.864，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：264个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
6211
|
overview
|
basic
|
[
"Mus musculus (39.4%)",
"Natronorubrum sulfidifaciens (11.2%)",
"Lepagella muris (7.5%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5908
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.561
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.945
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：459种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5908
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 0.97%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC01-A038
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.97%
- 读数：381,382
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC01-A038
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6561
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Parvularcula marina (27.0%)
- Neospora caninum (24.9%)
- Nesterenkonia natronophila (20.4%)
- Sus scrofa (12.0%)
- Alteribacter natronophilus (6.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.968，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：113个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
|
6561
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (27.0%)",
"Neospora caninum (24.9%)",
"Nesterenkonia natronophila (20.4%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 3667
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella copri (20.1%)
- Phocaeicola vulgatus (4.6%)
- Bacteroides caccae (4.6%)
- Prevotella stercorea (3.5%)
- Phocaeicola coprophilus (3.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.057，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：335个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
3667
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (20.1%)",
"Phocaeicola vulgatus (4.6%)",
"Bacteroides caccae (4.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4768
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：6.005
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.992
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1208种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4768
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 662
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.769
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.893
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：624种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
662
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4439
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.38
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.961
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1037种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4439
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7261
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.189
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.842
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：82种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
7261
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 367
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola vulgatus (9.7%)
- Blautia wexlerae (8.9%)
- Roseburia intestinalis (6.7%)
- Bacteroides faecis (6.4%)
- Bacteroides caccae (5.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.784，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：623个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
367
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (9.7%)",
"Blautia wexlerae (8.9%)",
"Roseburia intestinalis (6.7%)"
] |
请分析样本 1052 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 1052
|
根据样本 1052 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：28,403
- 检出物种数：18
- Shannon多样性指数：2.543
- Simpson多样性指数：0.897
**二、优势菌群**
- Ruthenibacterium lactatiformans (20.4%)
- Enterococcus alishanensis (16.6%)
- Clostridium fessum (8.7%)
- Parabacteroides distasonis (7.2%)
- Phocaeicola dorei (7.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
1052
|
overview
|
basic
|
[
"Ruthenibacterium lactatiformans (20.4%)",
"Enterococcus alishanensis (16.6%)",
"Clostridium fessum (8.7%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6214
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：0.753
多样性显著降低，提示可能存在明显菌群失调或优势菌过度增殖
- Simpson指数：0.343
优势度高，少数物种占主导地位
- 物种丰富度：86种
**菌群平衡状态评估：**
明显菌群失调，需进一步评估原因并考虑干预。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
6214
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6800
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.719
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.769
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：84种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
6800
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 5284 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5284
|
根据样本 5284 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：27,382,706
- 检出物种数：276
- Shannon多样性指数：3.515
- Simpson多样性指数：0.933
**二、优势菌群**
- Rhodococcus rhodochrous (16.1%)
- Rhodococcus pyridinivorans (15.6%)
- Chelatococcus caeni (6.0%)
- Pusillimonas noertemannii (5.4%)
- Pseudomonas composti (3.8%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5284
|
overview
|
basic
|
[
"Rhodococcus rhodochrous (16.1%)",
"Rhodococcus pyridinivorans (15.6%)",
"Chelatococcus caeni (6.0%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYQC06-A044
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.858
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.982
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1510种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYQC06-A044
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3025
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.889
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.953
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：400种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3025
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 553 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 553
|
根据样本 553 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：310,497,834
- 检出物种数：593
- Shannon多样性指数：4.04
- Simpson多样性指数：0.961
**二、优势菌群**
- Bacteroides uniformis (11.7%)
- Faecalibacterium prausnitzii (7.0%)
- Alistipes onderdonkii (6.0%)
- Bacteroides cellulosilyticus (5.7%)
- Bacteroides fragilis (5.4%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
553
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides uniformis (11.7%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (7.0%)",
"Alistipes onderdonkii (6.0%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4862
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.271
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.984
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：443种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4862
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1996
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.102
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.964
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：332种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1996
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 5966 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5966
|
根据样本 5966 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：2,637,418
- 检出物种数：632
- Shannon多样性指数：5.785
- Simpson多样性指数：0.994
**二、优势菌群**
- Bradyrhizobium liaoningense (3.7%)
- Reyranella soli (2.4%)
- Solirubrobacter ginsenosidimutans (2.4%)
- Bradyrhizobium algeriense (2.0%)
- Bradyrhizobium diazoefficiens (1.4%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5966
|
overview
|
basic
|
[
"Bradyrhizobium liaoningense (3.7%)",
"Reyranella soli (2.4%)",
"Solirubrobacter ginsenosidimutans (2.4%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3805
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.934
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.953
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：374种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3805
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3608
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.938
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.952
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：393种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3608
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: ZYQC05-H004
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Neisseria subflava (6.1%)
- Streptococcus mitis (4.7%)
- Prevotella melaninogenica (4.7%)
- Neisseria sicca (4.3%)
- Neisseria mucosa (3.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.794，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1108个物种
**关键发现：**
- 检出 10 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Neisseria属），总体正常
|
ZYQC05-H004
|
overview
|
basic
|
[
"Neisseria subflava (6.1%)",
"Streptococcus mitis (4.7%)",
"Prevotella melaninogenica (4.7%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 598
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Faecalibacterium prausnitzii (10.2%)
- Phocaeicola vulgatus (10.0%)
- Bacteroides uniformis (6.5%)
- Faecalibacterium duncaniae (5.7%)
- Bacteroides thetaiotaomicron (4.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.093，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：562个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
598
|
overview
|
basic
|
[
"Faecalibacterium prausnitzii (10.2%)",
"Phocaeicola vulgatus (10.0%)",
"Bacteroides uniformis (6.5%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4107
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bacteroides stercoris (12.9%)
- Blautia wexlerae (7.9%)
- Bacteroides caccae (4.4%)
- Phocaeicola vulgatus (4.4%)
- Fusicatenibacter saccharivorans (4.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.249，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：475个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
4107
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides stercoris (12.9%)",
"Blautia wexlerae (7.9%)",
"Bacteroides caccae (4.4%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY01A048
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 检出革兰阳性和革兰阴性菌，建议广谱抗菌治疗
- 可选：哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦或碳青霉烯类
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY01A048
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1613
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Klebsiella aerogenes (43.7%)
- Klebsiella pneumoniae (43.6%)
- Klebsiella africana (2.8%)
- Klebsiella variicola (2.6%)
- Klebsiella quasivariicola (2.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.308，表明菌群多样性较低
- 物种丰富度：103个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
- 优势菌含潜在致病属（Klebsiella），需警惕
|
1613
|
overview
|
basic
|
[
"Klebsiella aerogenes (43.7%)",
"Klebsiella pneumoniae (43.6%)",
"Klebsiella africana (2.8%)"
] |
请分析样本 4762 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 4762
|
根据样本 4762 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：932,628
- 检出物种数：69
- Shannon多样性指数：2.654
- Simpson多样性指数：0.91
**二、优势菌群**
- Staphylococcus aureus (13.0%)
- Listeria monocytogenes (12.2%)
- Enterococcus faecalis (11.4%)
- Bacillus spizizenii (10.3%)
- Limosilactobacillus fermentum (9.3%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
4762
|
overview
|
basic
|
[
"Staphylococcus aureus (13.0%)",
"Listeria monocytogenes (12.2%)",
"Enterococcus faecalis (11.4%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2900
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.838
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.947
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：432种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2900
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2607
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.962
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.953
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：341种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2607
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 0.09%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC02-A037
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.09%
- 读数：33,928
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC02-A037
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
检测到 Neisseria meningitidis，丰度为 0.39%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY04C045
|
Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.39%
- 读数：256,099
- 致病类别：systemic
- 临床风险等级：critical
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 立即进行确认检测
2. 启动感染控制措施
3. 进行药敏试验
4. 考虑会诊感染科
|
JXEY04C045
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Neisseria meningitidis"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 671
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.185
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.965
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：520种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
671
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 0.56%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC06-A062
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.56%
- 读数：165,565
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC06-A062
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 891
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Faecalibacterium prausnitzii (7.6%)
- Phocaeicola massiliensis (5.6%)
- Alistipes putredinis (4.0%)
- Phocaeicola vulgatus (4.0%)
- Prevotella copri (3.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.619，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：460个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
891
|
overview
|
basic
|
[
"Faecalibacterium prausnitzii (7.6%)",
"Phocaeicola massiliensis (5.6%)",
"Alistipes putredinis (4.0%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: NTC20250212-1
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.988
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.906
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：161种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
NTC20250212-1
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.09%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY02A001
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.09%
- 读数：60,783
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY02A001
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYQC07-A007
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Porphyromonas gingivalis（牙龈卟啉单胞菌）- 风险等级：medium
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC07-A007
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Porphyromonas gingivalis",
"Fusobacterium nucleatum"
] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 0.45%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY06D039
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.45%
- 读数：187,422
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY06D039
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
请分析样本 5099 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5099
|
根据样本 5099 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：282,704
- 检出物种数：318
- Shannon多样性指数：4.737
- Simpson多样性指数：0.979
**二、优势菌群**
- Acidovorax temperans (7.6%)
- Uruburuella suis (5.9%)
- Thauera terpenica (4.7%)
- Thauera phenylacetica (4.7%)
- Aliarcobacter cryaerophilus (4.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5099
|
overview
|
basic
|
[
"Acidovorax temperans (7.6%)",
"Uruburuella suis (5.9%)",
"Thauera terpenica (4.7%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3554
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.979
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.951
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：434种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3554
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6365
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Gilliamella apicola (12.2%)
- Bombilactobacillus mellis (10.8%)
- Bifidobacterium polysaccharolyticum (7.1%)
- Bifidobacterium choladohabitans (6.5%)
- Apis mellifera (6.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.107，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：108个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
6365
|
overview
|
basic
|
[
"Gilliamella apicola (12.2%)",
"Bombilactobacillus mellis (10.8%)",
"Bifidobacterium polysaccharolyticum (7.1%)"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 1.15%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYZJ06-A047
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：1.15%
- 读数：645,741
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度中等（1.1%），可能为致病原因或定植状态。需结合临床症状判断是否为病因。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYZJ06-A047
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2017
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Pan troglodytes (30.7%)
- Chlorocebus aethiops (8.4%)
- Pongo abelii (6.6%)
- Naegleria fowleri (5.3%)
- Macaca mulatta (4.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.262，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：279个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
2017
|
overview
|
basic
|
[
"Pan troglodytes (30.7%)",
"Chlorocebus aethiops (8.4%)",
"Pongo abelii (6.6%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4517
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Acidovorax temperans (5.4%)
- Streptococcus suis (5.2%)
- Trichococcus flocculiformis (3.5%)
- Acidovorax carolinensis (2.6%)
- Ottowia beijingensis (2.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.872，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：2868个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
4517
|
overview
|
basic
|
[
"Acidovorax temperans (5.4%)",
"Streptococcus suis (5.2%)",
"Trichococcus flocculiformis (3.5%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYZJ03-A004
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Prevotella intermedia（中间普雷沃菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYZJ03-A004
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Fusobacterium nucleatum",
"Prevotella intermedia"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1659
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Akkermansia muciniphila (15.7%)
- Phocaeicola vulgatus (8.8%)
- Faecalibacterium prausnitzii (6.5%)
- Neglectibacter timonensis (5.0%)
- Blautia schinkii (4.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.037，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：317个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
1659
|
overview
|
basic
|
[
"Akkermansia muciniphila (15.7%)",
"Phocaeicola vulgatus (8.8%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (6.5%)"
] |
请分析样本 5380 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5380
|
根据样本 5380 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,775,500
- 检出物种数：496
- Shannon多样性指数：5.363
- Simpson多样性指数：0.991
**二、优势菌群**
- Geodermatophilus siccatus (3.7%)
- Blastococcus mobilis (2.8%)
- Geodermatophilus obscurus (2.3%)
- Geodermatophilus africanus (2.3%)
- Geodermatophilus chilensis (2.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5380
|
overview
|
basic
|
[
"Geodermatophilus siccatus (3.7%)",
"Blastococcus mobilis (2.8%)",
"Geodermatophilus obscurus (2.3%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: PTC20250216-MLSE202502100006
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Staphylococcus aureus（金黄色葡萄球菌）- 风险等级：high
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
PTC20250216-MLSE202502100006
|
clinical
|
advanced
|
[
"Staphylococcus aureus"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY04A002
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY04A002
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Fusobacterium nucleatum",
"Streptococcus pneumoniae"
] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 1.26%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY03B006
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：1.26%
- 读数：789,682
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度中等（1.3%），可能为致病原因或定植状态。需结合临床症状判断是否为病因。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY03B006
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4859
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Ustilago hordei (7.8%)
- Corynebacterium maris (6.1%)
- Corynebacterium xerosis (4.0%)
- Triticum turgidum (2.3%)
- Pinus taeda (2.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.377，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：676个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
4859
|
overview
|
basic
|
[
"Ustilago hordei (7.8%)",
"Corynebacterium maris (6.1%)",
"Corynebacterium xerosis (4.0%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY06B003
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Candida albicans（白色念珠菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Cutibacterium acnes（痤疮丙酸杆菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 检出革兰阳性和革兰阴性菌，建议广谱抗菌治疗
- 可选：哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦或碳青霉烯类
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY06B003
|
clinical
|
advanced
|
[
"Candida albicans",
"Campylobacter concisus",
"Cutibacterium acnes"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 454
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.322
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.912
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：208种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
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454
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interpretation
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intermediate
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[] |
请分析样本 6886 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 6886
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根据样本 6886 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,629,505
- 检出物种数：75
- Shannon多样性指数：1.786
- Simpson多样性指数：0.792
**二、优势菌群**
- Parvularcula marina (27.6%)
- Neospora caninum (24.1%)
- Nesterenkonia natronophila (21.0%)
- Sus scrofa (16.3%)
- Alteribacter natronophilus (5.7%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
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6886
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overview
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basic
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[
"Parvularcula marina (27.6%)",
"Neospora caninum (24.1%)",
"Nesterenkonia natronophila (21.0%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 115
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.49
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.94
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：898种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
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115
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interpretation
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intermediate
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[] |
检测到 Cutibacterium acnes，丰度为 0.00%，请评估其临床意义。
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样本ID: PTC20250126-MLSE202501220003
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Cutibacterium acnes（痤疮丙酸杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.00%
- 读数：119
- 致病类别：skin
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
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PTC20250126-MLSE202501220003
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pathogen
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intermediate
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[
"Cutibacterium acnes"
] |
检测到 Prevotella intermedia，丰度为 0.14%，请评估其临床意义。
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样本ID: ZYYH04-A001
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Prevotella intermedia（中间普雷沃菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.14%
- 读数：72,354
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
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ZYYH04-A001
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pathogen
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intermediate
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[
"Prevotella intermedia"
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Subsets and Splits
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