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61
| input
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34
| output
stringlengths 132
823
| sample_id
stringlengths 1
28
| question_type
stringclasses 4
values | difficulty
stringclasses 3
values | species_involved
listlengths 0
3
|
|---|---|---|---|---|---|---|
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6954
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.243
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.822
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：233种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
6954
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4137
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola dorei (4.9%)
- Bacteroides uniformis (4.6%)
- Phocaeicola vulgatus (4.2%)
- Shigella flexneri (3.1%)
- Bacteroides thetaiotaomicron (2.9%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.99，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：3859个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
4137
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola dorei (4.9%)",
"Bacteroides uniformis (4.6%)",
"Phocaeicola vulgatus (4.2%)"
] |
检测到 Neisseria meningitidis，丰度为 0.16%，请评估其临床意义。
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样本ID: ZYQC03-A029
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Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.16%
- 读数：95,762
- 致病类别：systemic
- 临床风险等级：critical
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 立即进行确认检测
2. 启动感染控制措施
3. 进行药敏试验
4. 考虑会诊感染科
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ZYQC03-A029
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Neisseria meningitidis"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4088
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.476
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.966
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1725种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4088
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5280
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.319
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.92
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：258种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5280
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Cryptococcus neoformans，丰度为 0.00%，请评估其临床意义。
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样本ID: NTC20250126-MLSE202501210021
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Cryptococcus neoformans（新型隐球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.00%
- 读数：393
- 致病类别：fungal
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
NTC20250126-MLSE202501210021
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Cryptococcus neoformans"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1554
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Pan troglodytes (30.4%)
- Chlorocebus aethiops (7.6%)
- Pongo abelii (7.1%)
- Corynebacterium accolens (7.0%)
- Corynebacterium segmentosum (6.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.623，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：114个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
1554
|
overview
|
basic
|
[
"Pan troglodytes (30.4%)",
"Chlorocebus aethiops (7.6%)",
"Pongo abelii (7.1%)"
] |
请分析样本 763 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 763
|
根据样本 763 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：15,774,081
- 检出物种数：4712
- Shannon多样性指数：4.633
- Simpson多样性指数：0.957
**二、优势菌群**
- Prevotella copri (18.9%)
- Faecalibacterium prausnitzii (3.1%)
- Phocaeicola vulgatus (2.7%)
- Prevotella hominis (2.7%)
- Bacteroides uniformis (2.6%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
763
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (18.9%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (3.1%)",
"Phocaeicola vulgatus (2.7%)"
] |
请分析样本 4847 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 4847
|
根据样本 4847 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：771,909
- 检出物种数：660
- Shannon多样性指数：5.307
- Simpson多样性指数：0.982
**二、优势菌群**
- Micrococcus yunnanensis (7.5%)
- Micrococcus aloeverae (7.2%)
- Micrococcus luteus (5.5%)
- Cutibacterium acnes (3.7%)
- Micrococcus flavus (3.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
4847
|
overview
|
basic
|
[
"Micrococcus yunnanensis (7.5%)",
"Micrococcus aloeverae (7.2%)",
"Micrococcus luteus (5.5%)"
] |
请分析样本 2086 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 2086
|
根据样本 2086 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：20,664,024
- 检出物种数：385
- Shannon多样性指数：3.316
- Simpson多样性指数：0.89
**二、优势菌群**
- Prevotella copri (29.6%)
- Prevotella stercorea (7.0%)
- Prevotella hominis (6.4%)
- Bifidobacterium faecale (5.7%)
- Bifidobacterium adolescentis (5.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
2086
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (29.6%)",
"Prevotella stercorea (7.0%)",
"Prevotella hominis (6.4%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
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样本ID: 1349
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bifidobacterium bifidum (11.3%)
- Collinsella aerofaciens (10.7%)
- Bifidobacterium pseudocatenulatum (10.3%)
- Streptococcus salivarius (3.9%)
- Blautia massiliensis (3.8%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.884，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：388个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
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1349
|
overview
|
basic
|
[
"Bifidobacterium bifidum (11.3%)",
"Collinsella aerofaciens (10.7%)",
"Bifidobacterium pseudocatenulatum (10.3%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1199
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.23
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.821
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：67种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1199
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interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 6302 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 6302
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根据样本 6302 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：11,538,530
- 检出物种数：317
- Shannon多样性指数：2.487
- Simpson多样性指数：0.774
**二、优势菌群**
- Megamonas funiformis (37.6%)
- Megamonas rupellensis (28.0%)
- Peptacetobacter hiranonis (6.4%)
- Collinsella intestinalis (3.0%)
- Catenibacterium faecis (1.9%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
6302
|
overview
|
basic
|
[
"Megamonas funiformis (37.6%)",
"Megamonas rupellensis (28.0%)",
"Peptacetobacter hiranonis (6.4%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4190
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.394
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.972
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1551种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4190
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1038
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola dorei (7.9%)
- Bifidobacterium pseudocatenulatum (6.6%)
- Faecalibacterium prausnitzii (4.3%)
- Roseburia intestinalis (3.7%)
- Lachnospira pectinoschiza (3.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.471，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：319个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
1038
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola dorei (7.9%)",
"Bifidobacterium pseudocatenulatum (6.6%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (4.3%)"
] |
请分析样本 7467 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 7467
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根据样本 7467 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：34,167,342
- 检出物种数：589
- Shannon多样性指数：3.476
- Simpson多样性指数：0.93
**二、优势菌群**
- Bacteroides caecigallinarum (18.0%)
- Phocaeicola plebeius (12.4%)
- Phocaeicola barnesiae (6.9%)
- Prevotella rara (6.0%)
- Prevotella marseillensis (6.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
7467
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides caecigallinarum (18.0%)",
"Phocaeicola plebeius (12.4%)",
"Phocaeicola barnesiae (6.9%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
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样本ID: 4577
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Acidovorax temperans (6.1%)
- Faecalibacterium prausnitzii (6.1%)
- Dialister invisus (3.4%)
- Faecalibacterium duncaniae (2.2%)
- Acidovorax carolinensis (2.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.701，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：2782个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
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4577
|
overview
|
basic
|
[
"Acidovorax temperans (6.1%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (6.1%)",
"Dialister invisus (3.4%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 713
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.181
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.918
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：295种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
713
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 3609
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Akkermansia muciniphila (14.6%)
- Bacteroides uniformis (6.9%)
- Bacteroides caccae (6.4%)
- Bacteroides fragilis (4.1%)
- Bacteroides nordii (3.1%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.166，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：489个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
3609
|
overview
|
basic
|
[
"Akkermansia muciniphila (14.6%)",
"Bacteroides uniformis (6.9%)",
"Bacteroides caccae (6.4%)"
] |
请分析样本 93 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 93
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根据样本 93 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：4,650,926
- 检出物种数：493
- Shannon多样性指数：2.419
- Simpson多样性指数：0.854
**二、优势菌群**
- Thomasclavelia ramosa (27.3%)
- Actinomyces ihuae (15.0%)
- Schaalia radingae (12.9%)
- Klebsiella oxytoca (12.8%)
- Klebsiella michiganensis (10.7%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
93
|
overview
|
basic
|
[
"Thomasclavelia ramosa (27.3%)",
"Actinomyces ihuae (15.0%)",
"Schaalia radingae (12.9%)"
] |
请分析样本 5771 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 5771
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根据样本 5771 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：7,012,781
- 检出物种数：20
- Shannon多样性指数：0.963
- Simpson多样性指数：0.566
**二、优势菌群**
- Bathymodiolus azoricus thioautotrophic gill symbiont (47.3%)
- thiotrophic endosymbiont of Bathymodiolus puteoserpentis (Logatchev) (45.6%)
- Bathymodiolus brooksi thiotrophic gill symbiont (4.8%)
- methanotrophic endosymbiont of Bathymodiolus puteoserpentis (Logatchev) (1.1%)
- Bathymodiolus heckerae thiotrophic gill symbiont (1.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性显著降低，可能存在菌群失调，需关注潜在感染风险。
|
5771
|
overview
|
basic
|
[
"Bathymodiolus azoricus thioautotrophic gill symbiont (47.3%)",
"thiotrophic endosymbiont of Bathymodiolus puteoserpentis (Logatchev) (45.6%)",
"Bathymodiolus brooksi thiotrophic gill symbiont (4.8%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 5190
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.829
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.991
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1536种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5190
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
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