instruction
stringlengths 19
61
| input
stringlengths 7
34
| output
stringlengths 132
823
| sample_id
stringlengths 1
28
| question_type
stringclasses 4
values | difficulty
stringclasses 3
values | species_involved
listlengths 0
3
|
|---|---|---|---|---|---|---|
针对此微生物检测结果,应该采取什么治疗策略?
|
样本ID: JXEY06A033
|
治疗策略建议:
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)- 风险等级:high
- Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)- 风险等级:medium
- Campylobacter concisus(简明弯曲杆菌)- 风险等级:low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主,首选:万古霉素或利奈唑胺(疑似MRSA时)
- 非耐药菌可选:苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测(CRP、PCT)
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意:** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY06A033
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus"
] |
针对此微生物检测结果,应该采取什么治疗策略?
|
样本ID: ZYQC05-A084
|
治疗策略建议:
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus(简明弯曲杆菌)- 风险等级:low
- Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)- 风险等级:medium
- Prevotella intermedia(中间普雷沃菌)- 风险等级:low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 检出革兰阳性和革兰阴性菌,建议广谱抗菌治疗
- 可选:哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦或碳青霉烯类
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测(CRP、PCT)
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意:** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC05-A084
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Fusobacterium nucleatum",
"Prevotella intermedia"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum,丰度为 0.98%,请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY04A016
|
Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.98%
- 读数:765,982
- 致病类别:oral
- 临床风险等级:medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY04A016
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: 7294
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Anas platyrhynchos (30.4%)
- Mesorhizobium silamurunense (12.2%)
- Cobetia crustatorum (9.1%)
- Elizabethkingia argenteiflava (8.5%)
- Anser cygnoides (8.4%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为2.384,表明菌群多样性中等
- 物种丰富度:143个物种
**关键发现:**
- 无特殊发现
|
7294
|
overview
|
basic
|
[
"Anas platyrhynchos (30.4%)",
"Mesorhizobium silamurunense (12.2%)",
"Cobetia crustatorum (9.1%)"
] |
针对此微生物检测结果,应该采取什么治疗策略?
|
样本ID: JXEY02E001
|
治疗策略建议:
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)- 风险等级:high
- Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)- 风险等级:medium
- Campylobacter concisus(简明弯曲杆菌)- 风险等级:low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主,首选:万古霉素或利奈唑胺(疑似MRSA时)
- 非耐药菌可选:苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测(CRP、PCT)
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意:** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY02E001
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae,丰度为 0.38%,请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY03A036
|
Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.38%
- 读数:150,799
- 致病类别:respiratory
- 临床风险等级:high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
JXEY03A036
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 1292
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:4.701
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.982
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:416种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
1292
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 4558
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:4.992
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.987
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:310种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
4558
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 4129
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:4.52
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.979
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:409种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
4129
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 1549 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 1549
|
根据样本 1549 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:5,786,321
- 检出物种数:261
- Shannon多样性指数:3.247
- Simpson多样性指数:0.895
**二、优势菌群**
- Bacteroides xylanisolvens (27.4%)
- Roseburia inulinivorans (12.3%)
- Bacteroides ovatus (6.3%)
- Bacteroides luhongzhouii (4.7%)
- Bacteroides fragilis (4.7%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
1549
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides xylanisolvens (27.4%)",
"Roseburia inulinivorans (12.3%)",
"Bacteroides ovatus (6.3%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 6424
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:3.1
多样性良好,菌群结构相对平衡
- Simpson指数:0.929
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:101种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
6424
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 3334
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:3.868
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.949
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:420种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
3334
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果,应该采取什么治疗策略?
|
样本ID: ZYQC02-A022
|
治疗策略建议:
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)- 风险等级:high
- Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)- 风险等级:medium
- Campylobacter concisus(简明弯曲杆菌)- 风险等级:low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主,首选:万古霉素或利奈唑胺(疑似MRSA时)
- 非耐药菌可选:苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测(CRP、PCT)
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意:** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC02-A022
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 173
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:2.427
多样性中等,菌群结构相对集中
- Simpson指数:0.855
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:125种
**菌群平衡状态评估:**
菌群状态基本正常,持续监测即可。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
173
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Streptococcus pneumoniae,丰度为 0.54%,请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYYH04-A009
|
Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.54%
- 读数:395,962
- 致病类别:respiratory
- 临床风险等级:high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYYH04-A009
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
针对此微生物检测结果,应该采取什么治疗策略?
|
样本ID: ZYZJ02-A005
|
治疗策略建议:
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)- 风险等级:high
- Prevotella intermedia(中间普雷沃菌)- 风险等级:low
- Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)- 风险等级:medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主,首选:万古霉素或利奈唑胺(疑似MRSA时)
- 非耐药菌可选:苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测(CRP、PCT)
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意:** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYZJ02-A005
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Prevotella intermedia",
"Fusobacterium nucleatum"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum,丰度为 0.04%,请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC02-A029
|
Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.04%
- 读数:22,741
- 致病类别:oral
- 临床风险等级:medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC02-A029
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: 1147
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Pan troglodytes (33.7%)
- Actinomadura cremea (9.9%)
- Chlorocebus aethiops (8.1%)
- Pongo abelii (7.9%)
- Naegleria fowleri (7.7%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为2.472,表明菌群多样性中等
- 物种丰富度:88个物种
**关键发现:**
- 无特殊发现
|
1147
|
overview
|
basic
|
[
"Pan troglodytes (33.7%)",
"Actinomadura cremea (9.9%)",
"Chlorocebus aethiops (8.1%)"
] |
请分析样本 2591 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 2591
|
根据样本 2591 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:9,680,783
- 检出物种数:423
- Shannon多样性指数:4.7
- Simpson多样性指数:0.982
**二、优势菌群**
- Faecalibacterium prausnitzii (5.7%)
- Coprococcus aceti (5.7%)
- Gemmiger qucibialis (3.6%)
- Faecalibacterium hattorii (3.5%)
- Fusicatenibacter saccharivorans (3.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
2591
|
overview
|
basic
|
[
"Faecalibacterium prausnitzii (5.7%)",
"Coprococcus aceti (5.7%)",
"Gemmiger qucibialis (3.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: eZYYH04-A001
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:2.891
多样性良好,菌群结构相对平衡
- Simpson指数:0.895
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:389种
**菌群平衡状态评估:**
菌群状态基本正常,持续监测即可。
**可能原因分析:**
- 急性感染状态
|
eZYYH04-A001
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: ZYQC06-A079
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:2.218
多样性中等,菌群结构相对集中
- Simpson指数:0.8
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:706种
**菌群平衡状态评估:**
菌群状态基本正常,持续监测即可。
**可能原因分析:**
- 急性感染状态
|
ZYQC06-A079
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: NTC20250123-1
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Arabidopsis thaliana (58.2%)
- Nocardioides antri (8.6%)
- Pan troglodytes (4.6%)
- Salinarimonas soli (4.6%)
- Streptomyces malachitofuscus (3.4%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为1.904,表明菌群多样性中等
- 物种丰富度:165个物种
**关键发现:**
- 检出 1 种潜在病原体,需重点关注
- 菌群多样性偏低,可能存在菌群失调
|
NTC20250123-1
|
overview
|
basic
|
[
"Arabidopsis thaliana (58.2%)",
"Nocardioides antri (8.6%)",
"Pan troglodytes (4.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 6396
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:2.703
多样性良好,菌群结构相对平衡
- Simpson指数:0.897
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:82种
**菌群平衡状态评估:**
菌群状态基本正常,持续监测即可。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
6396
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: NTC20250216-MLSE202502100005
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Arabidopsis thaliana (21.7%)
- Ehrlichia minasensis (14.9%)
- Nocardioides agariphilus (9.5%)
- Vibrio marinisediminis (6.8%)
- Deinococcus aestuarii (4.0%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为3.028,表明菌群多样性良好
- 物种丰富度:190个物种
**关键发现:**
- 菌群多样性良好,微生态平衡
|
NTC20250216-MLSE202502100005
|
overview
|
basic
|
[
"Arabidopsis thaliana (21.7%)",
"Ehrlichia minasensis (14.9%)",
"Nocardioides agariphilus (9.5%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 695
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:4.174
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.961
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:455种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
695
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 7260
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:2.058
多样性中等,菌群结构相对集中
- Simpson指数:0.82
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:25种
**菌群平衡状态评估:**
菌群状态基本正常,持续监测即可。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
7260
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 5509
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:5.37
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.984
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:640种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
5509
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: 757
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Prevotella copri (38.7%)
- Prevotella hominis (11.1%)
- Faecalibacterium prausnitzii (3.4%)
- Roseburia inulinivorans (2.8%)
- Phocaeicola vulgatus (1.8%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为3.367,表明菌群多样性良好
- 物种丰富度:2399个物种
**关键发现:**
- 菌群多样性良好,微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群(Prevotella属),总体正常
|
757
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (38.7%)",
"Prevotella hominis (11.1%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (3.4%)"
] |
请分析样本 3029 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 3029
|
根据样本 3029 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:17,209,472
- 检出物种数:253
- Shannon多样性指数:2.193
- Simpson多样性指数:0.728
**二、优势菌群**
- Phocaeicola vulgatus (48.3%)
- Bacteroides fragilis (15.2%)
- Phocaeicola dorei (11.2%)
- Phocaeicola massiliensis (2.4%)
- Veillonella parvula (1.9%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围,建议定期监测。
|
3029
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (48.3%)",
"Bacteroides fragilis (15.2%)",
"Phocaeicola dorei (11.2%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: 342
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Thomasclavelia ramosa (21.7%)
- [Ruminococcus] gnavus (14.0%)
- Shigella flexneri (4.4%)
- Enterobacter hormaechei (3.3%)
- Klebsiella pneumoniae (3.3%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为3.381,表明菌群多样性良好
- 物种丰富度:268个物种
**关键发现:**
- 菌群多样性良好,微生态平衡
|
342
|
overview
|
basic
|
[
"Thomasclavelia ramosa (21.7%)",
"[Ruminococcus] gnavus (14.0%)",
"Shigella flexneri (4.4%)"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae,丰度为 0.63%,请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC02-A023
|
Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.63%
- 读数:691,547
- 致病类别:respiratory
- 临床风险等级:high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYQC02-A023
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
检测到 Prevotella intermedia,丰度为 0.12%,请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC05-A074
|
Prevotella intermedia(中间普雷沃菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.12%
- 读数:86,787
- 致病类别:oral
- 临床风险等级:low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC05-A074
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Prevotella intermedia"
] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: 4023
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Shigella flexneri (11.9%)
- Shigella sonnei (8.5%)
- Shigella boydii (7.4%)
- Shigella dysenteriae (6.5%)
- Escherichia coli (6.5%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为4.17,表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度:552个物种
**关键发现:**
- 菌群多样性良好,微生态平衡
- 优势菌含潜在致病属(Shigella),需警惕
|
4023
|
overview
|
basic
|
[
"Shigella flexneri (11.9%)",
"Shigella sonnei (8.5%)",
"Shigella boydii (7.4%)"
] |
请分析样本 7402 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7402
|
根据样本 7402 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:8,836,906
- 检出物种数:429
- Shannon多样性指数:4.693
- Simpson多样性指数:0.978
**二、优势菌群**
- Subdoligranulum variabile (7.0%)
- Streptococcus alactolyticus (5.9%)
- Pseudoflavonifractor phocaeensis (5.3%)
- Bacteroides caecigallinarum (4.6%)
- Phocaeicola plebeius (4.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
7402
|
overview
|
basic
|
[
"Subdoligranulum variabile (7.0%)",
"Streptococcus alactolyticus (5.9%)",
"Pseudoflavonifractor phocaeensis (5.3%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 4491
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:4.062
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.972
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:124种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
4491
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum,丰度为 0.71%,请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYZJ06-A031
|
Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.71%
- 读数:433,963
- 致病类别:oral
- 临床风险等级:medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYZJ06-A031
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
检测到 Tannerella forsythia,丰度为 0.04%,请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC03-A014
|
Tannerella forsythia(福赛坦氏菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.04%
- 读数:23,822
- 致病类别:oral
- 临床风险等级:medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC03-A014
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Tannerella forsythia"
] |
针对此微生物检测结果,应该采取什么治疗策略?
|
样本ID: ZYQC02-A036
|
治疗策略建议:
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)- 风险等级:high
- Streptococcus pyogenes(化脓性链球菌)- 风险等级:high
- Porphyromonas gingivalis(牙龈卟啉单胞菌)- 风险等级:medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 检出革兰阳性和革兰阴性菌,建议广谱抗菌治疗
- 可选:哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦或碳青霉烯类
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测(CRP、PCT)
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意:** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC02-A036
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Streptococcus pyogenes",
"Porphyromonas gingivalis"
] |
请分析样本 489 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 489
|
根据样本 489 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:2,170,426
- 检出物种数:297
- Shannon多样性指数:3.623
- Simpson多样性指数:0.868
**二、优势菌群**
- Prevotella copri (35.2%)
- Phocaeicola vulgatus (5.6%)
- Prevotella hominis (3.1%)
- Anaerostipes hadrus (2.3%)
- Catenibacterium faecis (2.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
489
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (35.2%)",
"Phocaeicola vulgatus (5.6%)",
"Prevotella hominis (3.1%)"
] |
请分析样本 6185 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 6185
|
根据样本 6185 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:10,053,933
- 检出物种数:58
- Shannon多样性指数:0.165
- Simpson多样性指数:0.043
**二、优势菌群**
- Prochlorococcus marinus (97.8%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性显著降低,可能存在菌群失调,需关注潜在感染风险。
|
6185
|
overview
|
basic
|
[
"Prochlorococcus marinus (97.8%)"
] |
请分析样本 161 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 161
|
根据样本 161 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:3,010,641
- 检出物种数:587
- Shannon多样性指数:2.008
- Simpson多样性指数:0.718
**二、优势菌群**
- Bifidobacterium breve (47.9%)
- Bifidobacterium bifidum (18.9%)
- Bifidobacterium longum (11.4%)
- Enterococcus faecalis (3.2%)
- Ruthenibacterium lactatiformans (2.8%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围,建议定期监测。
|
161
|
overview
|
basic
|
[
"Bifidobacterium breve (47.9%)",
"Bifidobacterium bifidum (18.9%)",
"Bifidobacterium longum (11.4%)"
] |
请分析样本 6387 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 6387
|
根据样本 6387 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:10,204,028
- 检出物种数:99
- Shannon多样性指数:2.759
- Simpson多样性指数:0.886
**二、优势菌群**
- Gilliamella apicola (26.4%)
- Lactobacillus melliventris (14.6%)
- Apis mellifera (9.3%)
- Nosema ceranae (7.1%)
- Lactobacillus kimbladii (4.7%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围,建议定期监测。
|
6387
|
overview
|
basic
|
[
"Gilliamella apicola (26.4%)",
"Lactobacillus melliventris (14.6%)",
"Apis mellifera (9.3%)"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae,丰度为 0.20%,请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY04C050
|
Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.20%
- 读数:39,687
- 致病类别:respiratory
- 临床风险等级:high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
JXEY04C050
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: ZYQC05-A092
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:5.01
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.986
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:1107种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 急性感染状态
|
ZYQC05-A092
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 4478
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:1.944
多样性中等,菌群结构相对集中
- Simpson指数:0.388
优势度高,少数物种占主导地位
- 物种丰富度:8166种
**菌群平衡状态评估:**
菌群状态基本正常,持续监测即可。
**可能原因分析:**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
4478
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 3739
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:1.212
多样性显著降低,提示可能存在明显菌群失调或优势菌过度增殖
- Simpson指数:0.458
优势度高,少数物种占主导地位
- 物种丰富度:117种
**菌群平衡状态评估:**
明显菌群失调,需进一步评估原因并考虑干预。
**可能原因分析:**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
3739
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 1998
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:4.138
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.972
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:299种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
1998
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果,应该采取什么治疗策略?
|
样本ID: ZYQC03-A031
|
治疗策略建议:
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus(简明弯曲杆菌)- 风险等级:low
- Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)- 风险等级:medium
- Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)- 风险等级:high
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 检出革兰阳性和革兰阴性菌,建议广谱抗菌治疗
- 可选:哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦或碳青霉烯类
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测(CRP、PCT)
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意:** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC03-A031
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Fusobacterium nucleatum",
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 2784
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:4.652
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.979
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:400种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
2784
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 2572
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:4.833
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.984
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:422种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
2572
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 4843
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:5.234
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.976
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:1130种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
4843
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 1619
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:1.643
多样性中等,菌群结构相对集中
- Simpson指数:0.621
中等均匀度,存在一定优势菌群
- 物种丰富度:99种
**菌群平衡状态评估:**
菌群状态基本正常,持续监测即可。
**可能原因分析:**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
1619
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 1227
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:3.317
多样性良好,菌群结构相对平衡
- Simpson指数:0.91
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:360种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
1227
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 5147
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:5.559
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.988
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:1446种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
5147
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 4570
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:5.565
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.981
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:2101种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
4570
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Cutibacterium acnes,丰度为 0.00%,请评估其临床意义。
|
样本ID: eJXEY05C001
|
Cutibacterium acnes(痤疮丙酸杆菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.00%
- 读数:248
- 致病类别:skin
- 临床风险等级:low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
eJXEY05C001
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Cutibacterium acnes"
] |
请分析样本 3414 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 3414
|
根据样本 3414 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:21,344,095
- 检出物种数:321
- Shannon多样性指数:2.911
- Simpson多样性指数:0.881
**二、优势菌群**
- Bifidobacterium longum (25.0%)
- Phocaeicola vulgatus (18.9%)
- Veillonella seminalis (8.6%)
- Bifidobacterium bifidum (6.3%)
- Faecalibacterium prausnitzii (5.3%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围,建议定期监测。
|
3414
|
overview
|
basic
|
[
"Bifidobacterium longum (25.0%)",
"Phocaeicola vulgatus (18.9%)",
"Veillonella seminalis (8.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 7454
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:3.811
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.947
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:361种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
7454
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 180 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 180
|
根据样本 180 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:3,211,549
- 检出物种数:750
- Shannon多样性指数:3.063
- Simpson多样性指数:0.883
**二、优势菌群**
- Bifidobacterium breve (25.4%)
- Bifidobacterium bifidum (17.1%)
- Bifidobacterium longum (12.5%)
- Collinsella aerofaciens (4.9%)
- Ruthenibacterium lactatiformans (4.3%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
180
|
overview
|
basic
|
[
"Bifidobacterium breve (25.4%)",
"Bifidobacterium bifidum (17.1%)",
"Bifidobacterium longum (12.5%)"
] |
针对此微生物检测结果,应该采取什么治疗策略?
|
样本ID: JXEY06A017
|
治疗策略建议:
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)- 风险等级:high
- Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)- 风险等级:medium
- Campylobacter concisus(简明弯曲杆菌)- 风险等级:low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主,首选:万古霉素或利奈唑胺(疑似MRSA时)
- 非耐药菌可选:苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测(CRP、PCT)
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意:** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY06A017
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum,丰度为 0.37%,请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYYH02-A031
|
Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.37%
- 读数:196,891
- 致病类别:oral
- 临床风险等级:medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYYH02-A031
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
请分析样本 1071 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 1071
|
根据样本 1071 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:14,157,774
- 检出物种数:322
- Shannon多样性指数:3.516
- Simpson多样性指数:0.904
**二、优势菌群**
- Bifidobacterium pseudocatenulatum (28.0%)
- Blautia wexlerae (6.4%)
- Bifidobacterium longum (5.3%)
- Blautia glucerasea (4.7%)
- Bacteroides faecis (3.6%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
1071
|
overview
|
basic
|
[
"Bifidobacterium pseudocatenulatum (28.0%)",
"Blautia wexlerae (6.4%)",
"Bifidobacterium longum (5.3%)"
] |
检测到 Porphyromonas gingivalis,丰度为 0.62%,请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC06-A022
|
Porphyromonas gingivalis(牙龈卟啉单胞菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.62%
- 读数:179,691
- 致病类别:oral
- 临床风险等级:medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC06-A022
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Porphyromonas gingivalis"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 3621
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:3.903
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.959
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:453种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
3621
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 7334
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:3.286
多样性良好,菌群结构相对平衡
- Simpson指数:0.831
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:557种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
7334
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum,丰度为 1.14%,请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY06D036
|
Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:1.14%
- 读数:528,955
- 致病类别:oral
- 临床风险等级:medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度中等(1.1%),可能为致病原因或定植状态。需结合临床症状判断是否为病因。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY06D036
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
针对此微生物检测结果,应该采取什么治疗策略?
|
样本ID: ZYQC01-A031
|
治疗策略建议:
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)- 风险等级:high
- Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)- 风险等级:medium
- Campylobacter concisus(简明弯曲杆菌)- 风险等级:low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 检出革兰阳性和革兰阴性菌,建议广谱抗菌治疗
- 可选:哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦或碳青霉烯类
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测(CRP、PCT)
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意:** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC01-A031
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus"
] |
请分析样本 345 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 345
|
根据样本 345 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:2,597,414
- 检出物种数:244
- Shannon多样性指数:4.008
- Simpson多样性指数:0.96
**二、优势菌群**
- Phocaeicola vulgatus (11.4%)
- Blautia wexlerae (10.0%)
- Fusicatenibacter saccharivorans (6.5%)
- Anaerostipes hadrus (3.8%)
- Bifidobacterium longum (3.8%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
345
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (11.4%)",
"Blautia wexlerae (10.0%)",
"Fusicatenibacter saccharivorans (6.5%)"
] |
请分析样本 3380 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 3380
|
根据样本 3380 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:22,462,263
- 检出物种数:334
- Shannon多样性指数:3.284
- Simpson多样性指数:0.915
**二、优势菌群**
- Phocaeicola vulgatus (21.9%)
- Phocaeicola dorei (12.0%)
- Bacteroides cellulosilyticus (7.2%)
- Bacteroides fragilis (7.2%)
- Alistipes onderdonkii (5.8%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
3380
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (21.9%)",
"Phocaeicola dorei (12.0%)",
"Bacteroides cellulosilyticus (7.2%)"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae,丰度为 0.68%,请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY04C034
|
Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.68%
- 读数:441,161
- 致病类别:respiratory
- 临床风险等级:high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
JXEY04C034
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
请分析样本 316 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 316
|
根据样本 316 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:3,580,950
- 检出物种数:244
- Shannon多样性指数:3.244
- Simpson多样性指数:0.857
**二、优势菌群**
- Phocaeicola vulgatus (35.6%)
- Phocaeicola dorei (9.2%)
- [Ruminococcus] gnavus (4.1%)
- Parabacteroides distasonis (2.4%)
- Bacteroides finegoldii (2.2%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
316
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (35.6%)",
"Phocaeicola dorei (9.2%)",
"[Ruminococcus] gnavus (4.1%)"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum,丰度为 0.29%,请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY07D015
|
Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.29%
- 读数:213,162
- 致病类别:oral
- 临床风险等级:medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY07D015
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: 174
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Prevotella copri (11.5%)
- Faecalibacterium prausnitzii (10.4%)
- Anaerostipes amylophilus (10.1%)
- Blautia wexlerae (6.2%)
- Blautia massiliensis (6.0%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为3.52,表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度:89个物种
**关键发现:**
- 菌群多样性良好,微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群(Prevotella属),总体正常
|
174
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (11.5%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (10.4%)",
"Anaerostipes amylophilus (10.1%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 3802
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:4.146
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.969
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:383种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
3802
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Streptococcus pneumoniae,丰度为 0.48%,请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYZJ05-A029
|
Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)检测分析:
**1. 病原体特征**
- 检出丰度:0.48%
- 读数:301,024
- 致病类别:respiratory
- 临床风险等级:high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低(<1%),可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状,仍需警惕;若无症状,可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYZJ05-A029
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
请分析样本 ZYYH02-A004 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: ZYYH02-A004
|
根据样本 ZYYH02-A004 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:46,363,123
- 检出物种数:888
- Shannon多样性指数:4.41
- Simpson多样性指数:0.97
**二、优势菌群**
- Nocardioides agariphilus (8.9%)
- Lysobacter prati (8.8%)
- Ramlibacter humi (5.7%)
- Streptococcus mitis (5.2%)
- Gluconacetobacter azotocaptans (4.3%)
**三、检出病原体情况**
检出 8 种潜在病原体:
- Streptococcus pneumoniae
- Fusobacterium nucleatum
- Prevotella intermedia
- Neisseria meningitidis
- Campylobacter concisus
- Tannerella forsythia
- Treponema denticola
- Cutibacterium acnes
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
ZYYH02-A004
|
overview
|
basic
|
[
"Nocardioides agariphilus (8.9%)",
"Lysobacter prati (8.8%)",
"Ramlibacter humi (5.7%)"
] |
请分析样本 6200 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 6200
|
根据样本 6200 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:579,903
- 检出物种数:28
- Shannon多样性指数:0.13
- Simpson多样性指数:0.032
**二、优势菌群**
- Prochlorococcus marinus (98.4%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性显著降低,可能存在菌群失调,需关注潜在感染风险。
|
6200
|
overview
|
basic
|
[
"Prochlorococcus marinus (98.4%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 1991
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:3.504
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.912
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:250种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
1991
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 7442
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:2.071
多样性中等,菌群结构相对集中
- Simpson指数:0.813
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:67种
**菌群平衡状态评估:**
菌群状态基本正常,持续监测即可。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
7442
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 7574
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:3.013
多样性良好,菌群结构相对平衡
- Simpson指数:0.891
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:263种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
7574
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 LJDX-03-A007 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: LJDX-03-A007
|
根据样本 LJDX-03-A007 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:13,841,335
- 检出物种数:742
- Shannon多样性指数:4.508
- Simpson多样性指数:0.975
**二、优势菌群**
- Actinomadura cremea (7.8%)
- Pan troglodytes (6.3%)
- Prevotella melaninogenica (5.2%)
- Microbacterium saperdae (4.7%)
- Prevotella jejuni (4.1%)
**三、检出病原体情况**
检出 9 种潜在病原体:
- Prevotella intermedia
- Fusobacterium nucleatum
- Porphyromonas gingivalis
- Treponema denticola
- Campylobacter concisus
- Streptococcus pneumoniae
- Tannerella forsythia
- Cutibacterium acnes
- Neisseria meningitidis
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
LJDX-03-A007
|
overview
|
basic
|
[
"Actinomadura cremea (7.8%)",
"Pan troglodytes (6.3%)",
"Prevotella melaninogenica (5.2%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 568
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:3.437
多样性良好,菌群结构相对平衡
- Simpson指数:0.888
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:647种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
568
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 4223 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 4223
|
根据样本 4223 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:642,176
- 检出物种数:251
- Shannon多样性指数:2.969
- Simpson多样性指数:0.817
**二、优势菌群**
- Cutibacterium acnes (40.1%)
- Pan troglodytes (11.3%)
- Staphylococcus capitis (6.3%)
- Malassezia restricta (3.2%)
- Chlorocebus aethiops (3.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围,建议定期监测。
|
4223
|
overview
|
basic
|
[
"Cutibacterium acnes (40.1%)",
"Pan troglodytes (11.3%)",
"Staphylococcus capitis (6.3%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: 2525
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Fusicatenibacter saccharivorans (5.0%)
- Faecalibacterium prausnitzii (5.0%)
- Phocaeicola vulgatus (3.6%)
- Coprococcus aceti (2.9%)
- Alistipes putredinis (2.6%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为4.727,表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度:419个物种
**关键发现:**
- 菌群多样性良好,微生态平衡
|
2525
|
overview
|
basic
|
[
"Fusicatenibacter saccharivorans (5.0%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (5.0%)",
"Phocaeicola vulgatus (3.6%)"
] |
请分析样本 1734 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 1734
|
根据样本 1734 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:31,718,187
- 检出物种数:484
- Shannon多样性指数:4.122
- Simpson多样性指数:0.953
**二、优势菌群**
- Bacteroides uniformis (16.5%)
- Phocaeicola plebeius (7.4%)
- Bacteroides humanifaecis (6.3%)
- Alistipes putredinis (5.0%)
- Bacteroides rodentium (3.8%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
1734
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides uniformis (16.5%)",
"Phocaeicola plebeius (7.4%)",
"Bacteroides humanifaecis (6.3%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: 256
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Prevotella copri (30.6%)
- Prevotella hominis (10.0%)
- Prevotellamassilia timonensis (5.2%)
- Roseburia inulinivorans (2.2%)
- Faecalibacterium prausnitzii (2.0%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为3.765,表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度:1350个物种
**关键发现:**
- 菌群多样性良好,微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群(Prevotella属),总体正常
|
256
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (30.6%)",
"Prevotella hominis (10.0%)",
"Prevotellamassilia timonensis (5.2%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: eZYQC06-A001
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:3.24
多样性良好,菌群结构相对平衡
- Simpson指数:0.933
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:347种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 急性感染状态
|
eZYQC06-A001
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 7339 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7339
|
根据样本 7339 的微生物检测结果分析:
**一、样本基本信息**
- 总测序读数:11,765,345
- 检出物种数:421
- Shannon多样性指数:3.94
- Simpson多样性指数:0.917
**二、优势菌群**
- Bacteroides caecigallinarum (26.9%)
- Bacteroides cellulolyticus (4.5%)
- Phocaeicola plebeius (3.5%)
- Streptococcus alactolyticus (3.1%)
- Methanobrevibacter woesei (2.9%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好,微生态状态相对健康。
|
7339
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides caecigallinarum (26.9%)",
"Bacteroides cellulolyticus (4.5%)",
"Phocaeicola plebeius (3.5%)"
] |
针对此微生物检测结果,应该采取什么治疗策略?
|
样本ID: ZYYH02-A021
|
治疗策略建议:
**一、主要关注病原体**
- Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)- 风险等级:medium
- Prevotella intermedia(中间普雷沃菌)- 风险等级:low
- Porphyromonas gingivalis(牙龈卟啉单胞菌)- 风险等级:medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主,首选:万古霉素或利奈唑胺(疑似MRSA时)
- 非耐药菌可选:苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测(CRP、PCT)
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意:** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYYH02-A021
|
clinical
|
advanced
|
[
"Fusobacterium nucleatum",
"Prevotella intermedia",
"Porphyromonas gingivalis"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: JXEY01D008
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:3.971
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.956
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:820种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 急性感染状态
|
JXEY01D008
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 4809
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:6.134
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.994
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:1215种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
4809
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: 2598
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Ruminococcus bromii (4.9%)
- Akkermansia muciniphila (3.8%)
- Alistipes onderdonkii (3.6%)
- Bifidobacterium pseudocatenulatum (3.5%)
- Alistipes putredinis (3.4%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为4.896,表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度:529个物种
**关键发现:**
- 菌群多样性良好,微生态平衡
|
2598
|
overview
|
basic
|
[
"Ruminococcus bromii (4.9%)",
"Akkermansia muciniphila (3.8%)",
"Alistipes onderdonkii (3.6%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: 6361
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Bartonella apis (18.3%)
- Snodgrassella alvi (11.4%)
- Gilliamella apis (7.6%)
- Lactobacillus apis (7.6%)
- Bartonella apihabitans (6.2%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为2.984,表明菌群多样性良好
- 物种丰富度:66个物种
**关键发现:**
- 无特殊发现
|
6361
|
overview
|
basic
|
[
"Bartonella apis (18.3%)",
"Snodgrassella alvi (11.4%)",
"Gilliamella apis (7.6%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
|
样本ID: 1722
|
样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Phocaeicola vulgatus (17.6%)
- Faecalibacterium prausnitzii (14.4%)
- Gemmiger formicilis (10.6%)
- Faecalibacterium longum (5.7%)
- Bacteroides stercoris (3.5%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为3.662,表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度:509个物种
**关键发现:**
- 菌群多样性良好,微生态平衡
|
1722
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (17.6%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (14.4%)",
"Gemmiger formicilis (10.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: PTC20250210-1
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:3.146
多样性良好,菌群结构相对平衡
- Simpson指数:0.923
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:173种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 急性感染状态
|
PTC20250210-1
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果,应该采取什么治疗策略?
|
样本ID: ZYQC02-A044
|
治疗策略建议:
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)- 风险等级:high
- Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)- 风险等级:medium
- Campylobacter concisus(简明弯曲杆菌)- 风险等级:low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 检出革兰阳性和革兰阴性菌,建议广谱抗菌治疗
- 可选:哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦或碳青霉烯类
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测(CRP、PCT)
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意:** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC02-A044
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: JXEY04C002
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:4.353
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.96
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:1177种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 急性感染状态
|
JXEY04C002
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么?是否存在菌群失调?
|
样本ID: 6084
|
菌群多样性分析:
**多样性指标解读:**
- Shannon指数:4.898
多样性非常高,菌群结构均匀
- Simpson指数:0.987
均匀度高,物种分布较为均衡
- 物种丰富度:257种
**菌群平衡状态评估:**
菌群平衡状态良好,微生态环境健康。
**可能原因分析:**
- 当前无明显异常因素
|
6084
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果,应该采取什么治疗策略?
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样本ID: ZYQC03-A060
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治疗策略建议:
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae(肺炎链球菌)- 风险等级:high
- Campylobacter concisus(简明弯曲杆菌)- 风险等级:low
- Fusobacterium nucleatum(具核梭杆菌)- 风险等级:medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主,首选:万古霉素或利奈唑胺(疑似MRSA时)
- 非耐药菌可选:苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测(CRP、PCT)
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意:** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
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ZYQC03-A060
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clinical
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advanced
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[
"Streptococcus pneumoniae",
"Campylobacter concisus",
"Fusobacterium nucleatum"
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该样本的主要微生物组成是什么?有哪些值得关注的发现?
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样本ID: 7049
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样本微生物组成分析:
**主要菌群组成:**
- Neospora caninum (28.0%)
- Parvularcula marina (27.3%)
- Nesterenkonia natronophila (20.2%)
- Sus scrofa (11.5%)
- Alteribacter natronophilus (6.5%)
**多样性评估:**
- Shannon指数为1.868,表明菌群多样性中等
- 物种丰富度:116个物种
**关键发现:**
- 菌群多样性偏低,可能存在菌群失调
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7049
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overview
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basic
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[
"Neospora caninum (28.0%)",
"Parvularcula marina (27.3%)",
"Nesterenkonia natronophila (20.2%)"
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